Thèse
Recherche sur la dérogation en droit public. Thèse soutenue en 1993 à Bordeaux 1, sous la direction de Jean-Marie Auby.
Ouvrages
Aude Rouyère, Sébastien Martin et Jean-Baptiste Vila (dir.), La réforme du droit de la régulation des jeux : [actes du colloque des 21 et 23 octobre 2020], LexisNexis, 2022, 153 p. 
Aude Rouyère, Jean-Baptiste Vila et Sébastien Martin (dir.), La notion de jeu(x) d'argent : actes du colloque du 15 mai 2019 et du séminaire du 23 novembre 2018, LexisNexis, 2020, 203 p.
Aude Rouyère, Lucie Cluzel-Métayer, Pascal Combeau, Anne-Laure Girard, Pascale Idoux, Martine Lombard, Sébastien Martin, Benoît Plessix, Hugo-Bernard Pouillaude, Olivier Renaudie et Christophe Roux, Le droit administratif au défi du numérique : [actes du 12e Colloque annuel de l'AFDA, 13-15 juin 2018, Bordeaux], Dalloz, 2019, Thèmes et commentaires, 233 p.
Aude Rouyère, Xavier Bioy, Pascale Idoux, Philippe Terneyre, Richard Moussaron et Henri Oberdorff, L’identité des tribunaux administratifs : actes du colloque organisé les 28 et 29 octobre 2013 à [Toulouse], LGDJ , Lextenso éditions, 2014, Grands colloques
Aude Rouyère et Jean-François Brisson, Droit administratif, Montchrestien, 2004, Pages d'amphi, 664 p.
Aude Rouyère, Le permis de construire en tant qu'instrument de protection de l'environnement, 1987, 243 p.
Voir plus
Aude Rouyère, L'utilisation du mot "manifeste" dans la jurisprudence administrative, 1985, 151 p.
Articles
Aude Rouyère, « La réforme des jeux d'argent et de hasard », Revue française de droit administratif, N° 4, 2019, p. 612 
Aude Rouyère, « La place des tiers dans la répression administrative », Revue de science criminelle et de droit pénal comparé, N° 2, 2019, p. 301
Aude Rouyère, « Le statut : une mise en ordre pragmatique », Revue française de droit administratif, N° 3, 2017, p. 413
Aude Rouyère, « A propos des voies d'accès au corps des professeurs des universités », Actualité juridique Droit administratif, N° 15, 2012, p. 785
Aude Rouyère, « La constitutionnalisation des autorités administratives indépendantes : quelle signification ? », Revue française de droit administratif, N° 5, 2010, p. 887
Aude Rouyère, « Statut des universitaires : se placer au-delà des contingences des gestions locales », Actualité juridique Droit administratif, N° 1, 2009, p. 1
Voir plus
Aude Rouyère, « Variations jurisprudentielles à propos du lien de causalité entre vaccination contre l'hépatite B et sclérose en plaques », Revue française de droit administratif, N° 5, 2008, p. 1011
Aude Rouyère, « Principe de précaution et responsabilité civile des personnes publiques », Recueil Dalloz, N° 22, 2007, p. 1537
Aude Rouyère, « L'exigence de précaution saisie par le juge », Revue française de droit administratif, N° 2, 2000, p. 266
Autre
Aude Rouyère, Xavier Bioy, Pascale Idoux, Richard Moussaron, Henri Oberdorff et Philippe Terneyre, L'identité des tribunaux administratifs, in Xavier Bioy, Pascale Idoux, Richard Moussaron, Henri Oberdorff, Aude Rouyère, Philippe Terneyre (dir.), Issy-les-Moulineaux, LGDJ, pp. IX-465
