Thèse
Recherche sur le fondement juridique des discriminations compensatoires en droit public français. Thèse soutenue en 2007 à Montpellier 1, sous la direction de Jean-Louis Autin.
Ouvrages
François Cafarelli (dir.), La résilience des territoires exposés aux risques naturels : le droit à l'épreuve des risques, mare & martin, 2023, Droit public, 413 p. 
François Cafarelli et Didier Blanc (dir.), 1946-2016 : Soixante-dix ans de départementalisation ultra-marine. Entre unité constitutionnelle et diversité législative dans la République : entre unité constitutionnelle et diversité législative dans la République, Presses universitaires d'Aix-Marseille, 2018, Collection Droit d'outre-mer

François Cafarelli, Le petit droit public : 2014 l'incontournable en 21 fiches, Dunod, 2014, Les petits experts, 48 p. 
François Cafarelli, Droit public, Dunod, 2013, Les points clés, 48 p. 
François Cafarelli, Recherche sur le fondement juridique des discriminations compensatoires en droit public français, 2007, 590 p. 
Articles
François Cafarelli, « Contrat de projet ou emploi d'expert de haut niveau et de directeur de projet : comment choisir ? », AJFP. Actualité juridique Fonctions publiques, 2023, p. 276 
François Cafarelli, « L'accessibilité des bâtiments : un chantier toujours inachevé », RDSS. Revue de droit sanitaire et social, 2023, p. 5 
François Cafarelli, « Les faveurs de la Cour de cassation pour le délit de favoritisme », Actualité juridique Droit administratif, 2023, p. 284 
François Cafarelli, « L'encadrement des accords-cadres : la quadrature du cercle », Actualité juridique Droit administratif, N° 21, 2022, p. 1229 
François Cafarelli, « La loi 3DS et les outre-mer », AJCT. Actualité juridique Collectivités territoriales, N° 6, 2022, p. 313 
François Cafarelli et Caroline Lantero, « Le maquis des modalités d'exercice de l'activité libérale à l'hôpital », Actualité juridique Droit administratif, 2022, p. 2021 