Thèse
La liberté de manifestation. Thèse soutenue en 1999 à Lyon 2, sous la direction de Édith Jaillardon.
Ouvrage
Philippe Juen, L' environnement juridique du vétérinaire sanitaire : quelles juridictions, quelles institutions, quelles normes, quelles responsabilités ?, École nationale des services vétérinaires, 2010, 115 p. 
Articles
Philippe Juen, « Le rapprochement de conjoint des enseignants-chercheurs : un droit à distance variable », L'Actualité juridique. Droit administratif, N° 29, 2022, p. 1669
Philippe Juen, « Equipements ludiques et sportifs de proximité et responsabilité des collectivités territoriales », La Semaine Juridique - Administrations et collectivités territoriales, N° 17, 2009, pp. 37-44
Philippe Juen, « Convention sur la protection des Alpes et transport en droit français », Revue européenne de Droit de l'environnement, N° 1, 2009, pp. 33-64
Philippe Juen, « L'autorisation parlementaire dans la loi organique relative aux lois de Finances : réforme ou continuité ? », Les Petites Affiches, 2002, pp. 6-13 et 8-14
Philippe Juen, « La compatibilité du principe d'inaliénabilité avec la valorisation économique du domaine public », Revue de Droit Immobilier, 2000, pp. 121-143
Philippe Juen, « Les pouvoirs du juge du contrat face à la nullité du contrat (Cour administrative d'appel de Lyon, 25 mai 1999, S.A. « Domaine du golf du Lavandou » c/ Commune du Lavandou) », Revue française de droit administratif, 2000, pp. PP 1219-1231
