Jean-Pierre Allinne et Renaud Carrier (dir.), La culture au risque du marché, le mécénat face à ses acteurs : cet ouvrage reproduit les actes d'un colloque organisé à l'Université de Pau [par le Programme de recherches historiques sur l'administration locale, Centre d'études des collectivités territoriales] les 19 et 20 juin 2008 sous le titre "Les deniers de la culture. Le mécénat, nouveau paradigme ?", l'Harmattan, 2010, Droit du patrimoine culturel et naturel, 223 p.

Jean-Pierre Allinne et Mathieu Soula (dir.), Les récidivistes : représentations et traitements de la récidive, XIXe-XXIe siècle actes du colloque international de Pau, 9 et 10 décembre 2009, Presses universitaires de Rennes, 2010, Histoire, 286 p.

Jean-Pierre Allinne et Renaud Carrier (dir.), Gérer la culture en région : les pratiques des collectivités territoriales en France, L'Harmattan, 2006, Gestion de la culture et du secteur non lucratif, 219 p.

Jean-Pierre Allinne, L'anthropophage des Pyrénées : le procès de Blaise Ferrage, violeur et assassin à la fin du XVIIIe siècle, Cairn, 2005, Collection Histoire d'un crime, 192 p.

Jean-Pierre Allinne, Gouverner le crime : les politiques criminelles françaises de la Révolution au XXIe siècle, l'Harmattan, 2004, Traité de sciences criminelles, 304 p.

Jean-Pierre Allinne, Gouverner le crime : les politiques criminelles françaises de la Révolution au XXIe siècle, L'Harmattan, 2003, Sciences criminelles, 301 p.

Jean-Pierre Allinne et Renaud Carrier (dir.), Préfet et développement local, Dalloz, 2002, Thèmes & commentaires, 291 p.

Jean-Pierre Allinne, Banquiers et bâtisseurs : un siècle de Crédit foncier, 1852-1940, Editions du CNRS, 1984, Sciences sociales, 243 p.

Jean-Pierre Allinne et Christian Schnakenbourg, Communautés de métiers contre liberté économique à la fin de l'Ancien régime : l'exemple des gribanniers de la Somme son rôle, ses opérations de 1816 à 1895, Presses universitaires de France, 1976, Travaux et recherches de l'Université de droit, d'économie et de sciences sociales de Paris, 175 p.

Jean-Pierre Allinne, La Caisse des dépôts et consignations : Son rôle, ses opérations de 1816 à 1895, 1972, 149 p.

Jean-Pierre Allinne, « 1948 ou les promesses confisquées. Le droit de grève victime de la guerre froide? », in Jena-Pierre Massias (dir.), La grève des mineurs de 1948 et la justice institutionnelle, Paris, Fondation Varenne, 2019, p. NC

Jean-Pierre Allinne, « Entre la prison et l’asile, l’aliéné, un objet non identifié de la psychiatrie pénitentiaire », Dynamiques pénales et pénitentiaires. Pensées et politiques réformatrices en Occident (XXe-XXIe siècle, Presses de l’ENAP, 2019, pp. 189-213

Jean-Pierre Allinne, « Le juge d’instruction, une histoire française, une histoire dépassée ? », in S. Blot-Maccagnan, G. Callemein (dir.), Du lieutenant criminel au juge d’instruction. Evolutions historiques et défis contemporains, Rennes, PUR, 2018, pp. 53-71

Jean-Pierre Allinne, « Monde de l'écrit et monde de l'oralité: la sorcellerie au tournant de la modernité, deux procès pyrénéens au XVIe siècle », Sorcellerie, Pouvoirs : écrits et représentations, PUPPA, 2018, pp. 83-106

Jean-Pierre Allinne, « Une société qui refuse d'oublier. Les techniques d'oubli malmenées ou la défaite de Chronos », Justice et oubli : France-Rwanda, Paris, La Documentation Française, N° 28, 2017, pp. 149-178

Jean-Pierre Allinne, « De « la sentinelle avancée de la société » à la coproduction de la sécurité », Les Cahiers de la justice, N° 1, 2016, pp. 17-29

Jean-Pierre Allinne, « L'héritage de l'histoire - De « la sentinelle avancée de la société » à la coproduction de la sécurité », Les Cahiers de la justice, N° 1, 2016, p. 17 

Jean-Pierre Allinne, « La Cour d’appel de Pau et la coutume, de la défiance à la reconnaissance », Les cours d’appel, origine et enjeux contemporains, Rennes, PUR, 2016, pp. 97-117

Jean-Pierre Allinne, « Les politiques criminelles en France au XIX° siècle, de Jupiter à Apollon, le retour du positivisme ? », Les prémices d’une science européenne du droit criminel, Paris, Campus ouvert/L’Harmattan, 2016, pp. 291-329

Jean-Pierre Allinne, Jean-Paul Jean, Denis Salas et Claude Gauvard, « Introduction. Le peuple en justice », in Jean-Pierre Allinne, Claude Gauvard, Jean-Paul Jean (dir.), Le peuple en justice, Paris, La documentation française, 2014, pp. 9-11 

Jean-Pierre Allinne, « Deux siècles de course Landaise jeu, sport, spectacle ? », Jurisport : La revue juridique et économique du sport, N° 64, 2002, p. 105