Thèse
Le critère de l'exercice illégal de la médecine, 1673-1793 : entre défaut de droit et manière de soigner. Thèse soutenue en 2000 à Université Robert Schuman (Strasbourg) (1971-2008), sous la direction de Jean-Michel Poughon.
Ouvrages
Céline Pauthier, Philippe Auvergnon, Françoise Curtit, René de Quenaudon, Anne Fornerod, Vincente Fortier, Gérard Gonzalez, Thierry Rambaud, Isabelle Riassetto, Michel Storck, Yves Strickler, Nadine B Weibel, Jean-Paul Willaime, Anne-Laure Zwilling, Marc Aoun, Jean-Luc Hiebel, Rik Torfs, Jeanne-Marie Tuffery-Andrieu, Patrick Valdrini, Samim Akgönül, Brigitte Basdevant-Gaudemet, Michel Deneken, Silvio Ferrari, Franck Frégosi, Iván Carlos Ibán, Marcel Metzger, Pierre-Henri Prélot, Miguel Rodríguez Blanco, Balázs Schanda et Jean-Marie Woehrling, Droit et religion en Europe : études en l'honneur de Francis Messner, Presses universitaires de Strasbourg, 2014, Société, droit et religion, 582 p. 
Céline Pauthier, L'exercice illégal de la médecine : 1673-1793 entre défaut de droit et manière de soigner, Glyphe & Biotem éditions, 2002, Histoire, médecine et société, 672 p.
Céline Pauthier, L'exercice illégal de la médecine : 1673-1793 entre défaut de droit et manière de soigner, [s.n.], 2000, 687 p.
Articles
Céline Pauthier, Ophélie Rillon, Maria Benedita-Basto, Françoise Blum, Pierre Guidi, Héloïse Kiriakou, Martin Mourre, Alexis Roy et Elena Vezzadini, « Pour une histoire des socialismes en Afrique : introduction », Socialismes en Afrique. Socialisms in Africa, Paris, Les éditions de la Maison des sciences de l'homme, 2021, p. NC
Céline Pauthier, « La femme au pouvoir, ce n’est pas le monde à l’envers », in Muriel Gomez-Perez (dir.), Femmes d'Afrique et émancipation : entre normes sociales contraignantes et nouveaux possibles, Paris, Éditions Karthala, 2018, pp. 73-113
Céline Pauthier, « Médecine des pauvres au 18 siècle : des soignants sous contrôle », Revue fondamentale des questions hospitalières, 2003, pp. 63-134
