Expérimentation et administration territoriale, soutenue en 2008 à Montpellier 1 sous la direction de Jean-Louis Autin 

Sébastien Denaja, Nathalie Laval Mader, Florence Crouzatier-Durand, André Viola, L'avenir des collectivités territoriales intermédiaires en Europe, 116^e éd., Institut de la décentralisation, 2019 

Sébastien Denaja, Michel Clapié, Pascale Idoux (dir.), Indépendance(s): études offertes au professeur Jean-Louis Autin, Université de Montpellier I-CREAM, 2012, Collection Mélanges, 1695 p. 

Sébastien Denaja, Expérimentation et administration territoriale, Atelier national de reproduction des thèses, Université de Lille 3, 2010, Lille-thèses 

Sébastien Denaja, Vincent Aubelle, Nicolas Kada, « Pierre Joxe : l'inspiration d'un nouveau souffle intercommunal et la consécration de la dualité de l'administration territoriale », Les grandes figures de la décentralisation. De l'Ancien Régime à nos jours., Berger-Levrault, 2019, pp. 469-478 

Sébastien Denaja, « Casinos et concessions de service public », Contrats publics, Vol. I. Mélanges en l'honneur du professeur Michel Guibal, Presses de la Faculté de droit de Montpellier, 2006, pp. 657-676 

Sébastien Denaja, « Le département, de la résistance à la résilience », Pouvoirs Locaux. Les cahiers de la décentralisation, Institut de la décentralisation, 2019, n°116, pp. 65-72 

Sébastien Denaja, « L'expérimentation, méthode privilégiée de réforme de l'administration territoriale », Revue Lamy des collectivités territoriales, , 2009, n°46, pp. 75-82 

Sébastien Denaja, « Le Défenseur des droits », Politeia, , 2009, n°15 

Sébastien Denaja, « L'égalité femmes-hommes, 10 ans après la loi Vallaud-Belkacem », le 29 novembre 2024  

Sébastien Denaja, « Variations actuelles autour de la solidarité territoriale », le 19 septembre 2024  

Sébastien Denaja, « Le pluralisme local », le 08 février 2024  

Sébastien Denaja, « Les alliances territoriales. Quelle efficacité pour la qualité et la proximité de nos services publics ? », le 16 février 2023  

Sébastien Denaja, « Urbanisme et commerce, focus sur les enjeux innovants », le 16 décembre 2022  

Sébastien Denaja, « Voter les budgets locaux en 2022, vers de nouvelles pratiques ? », le 16 septembre 2022  

Sébastien Denaja, « L'avenir des collectivités territoriales intermédiaires en Europe », le 15 novembre 2019