Thèse
Recherche sur le principe de séparation en droit public français. Thèse soutenue en 2010 à Toulouse 1, sous la direction de Jean-Arnaud Mazères.
Ouvrages
Christophe Alonso, Arnaud Duranthon et Julia Schmitz (dir.), La pensée du doyen Hauriou à l'épreuve du temps : quel(s) héritage(s) ?, Presses Universitaires d'Aix-Marseille, 2015, 711 p. 
Christophe Alonso, Recherche sur le principe de séparation en droit public français, PUAM, 2015, 886 p.
Articles
Christophe Alonso, « Faut-il faire une croix sur la statue du pape Jean-Paul II ? », Recueil Dalloz, N° 1, 2018, p. 56
Christophe Alonso, « Les contours de l'office du juge du référé-liberté durant l'état d'urgence », L'Actualité juridique. Droit administratif, N° 23, 2016, p. 1303
Christophe Alonso, « Le référé-liberté, la police administrative et l'état d'urgence : contexte actuel », Actualité juridique. Collectivités territoriales - AJCT, N° 11, 2016, p. 552
Christophe Alonso, « La responsabilité du fait des infections nosocomiales : état des lieux d'un régime en devenir », Revue française de droit administratif, N° 2, 2011, p. 329
