Thèse
La répression des manifestations séditieuses de l'opposition politique en Maine-et-Loire au dix-neuvième siècle, 1814-1870. Thèse soutenue en 1995 à Rennes 1, sous la direction de Marie-Yvonne Crépin.
Ouvrages
Christophe Aubert, Le temps des conspirations : la répression politique en Maine-et-Loire entre 1814 et 1870, Cheminements, 2006, 397 p. 
Christophe Aubert, Influence de traitements fongicides inhibiteurs de la biosynthèse de l'ergostérol sur le potentiel aromatique du raisin Muscat d'Alexandrie, de la pomme Golden delicious et des produits dérivés, [s.n.], 1997, 188 p.
Christophe Aubert, La répression des manifestations séditieuses de l'opposition politique en Maine-et-Loire au dix-neuvième siècle (1814-1870), 1995, 3 vol., p.
Christophe Aubert, Détermination de la configuration absolue du 3-oxo-alpha-ionol et de la hydroxy-bêta-damascone dans le raisin, Université Montpellier II Sciences et Techniques du Languedoc, 1993, 31 p.
Articles
Christophe Aubert, Wilfried Chevalier, Sitti-Anlati Moussa, Miguel Medeiros Netto Ottoni, Cécile Dubois-Laurent, Sébastien Huet, Elsa Desnoues, Brigitte Navez, Valentine Cottet, Guillaume Chalot, Michel Jost, Laure Barrot, Gerald Freymark, Maarten Uittenbogaard, François Chaniet, Arnaud Gauffreteau, Anita Suel, Marie-Hélène Bouvier Merlet, Latifa Hamama, Valérie Le Clerc, Mathilde Briard, Didier Peltier et Emmanuel Geoffriau, « Evaluation of pedoclimatic factors and cultural practices effects on carotenoid and sugar content in carrot root », European Journal of Agronomy, 2022, p. 126577
Christophe Aubert, Onrawee Laguerre, Alain Denis, Nadir Bouledjeraf, Steven Duret, Evelyne Derens Bertheau, Jean Moureh et Denis Flick, « Heat transfer and aroma modeling of fresh fruit and vegetable in cold chain: case study on tomatoes », International Journal of Refrigeration, N° 133, 2021, pp. 133-144
Christophe Aubert, Wilfried Chevalier, Sitti-Anlati Moussa, Miguel Medeiros Netto Ottoni, Cécile Dubois-Laurent, Elsa Desnoues, Brigitte Navez, Valentine Cottet, Guillaume Chalot, Michel Jost, Laure Barrot, Gerald Freymark, Maarten Uittenbogaard, François Chaniet, Anita Suel, Marie-Hélène Bouvier Merlet, Latifa Hamama, Valérie Le Clerc, Mathilde Briard, Didier Peltier et Emmanuel E. Geoffriau, « Multisite evaluation of phenotypic plasticity for specialized metabolites, some involved in carrot quality and disease resistance », PLoS ONE, N° 4, 2021, p. e0249613
Christophe Aubert, Valérie Le Clerc, Valentine Cottet, Claire Yovanopoulos, Mathilde Piquet, Anita Suel, Sébastien Huet, Claude Koutouan, Latifa Hamama, Guillaume Chalot, Michel Jost, Besnik Pumo et Mathilde Briard, « Breeding for carrot resistance to Alternaria dauci without compromising taste », Molecular Breeding, N° 4, 2019, p. 59
Christophe Aubert, Valentine Cottet, Christian Hutin, Catherine Roty, Danièle Scandella, Yoann Graciot, Jawad Aarrouf, Laurent L. Urban, Jalloul Bouajila, Sandrine Costa, Christelle Venant-Valery, Camille Cot et Pasacal Rousse, « Qualité nutritionnelle du raisin de table : une étude pour définir les appétences des consommateurs », Infos CTIFL, N° 347, 2018, pp. 16-29
Christophe Aubert, « Cour de cassation (ch. crim.), 1er décembre 2015 », Le Droit ouvrier, N° 813, 2016, pp. 221-225
Voir plus
Christophe Aubert, Vincent Mathieu-Hurtiger, Philippe Bony, Laurence Conq, Bethsabée Gleizer, Pierre Landry, Pierre Vaysse, Marie-Eve Biargues, Ghislaine Monteils, Pascale Westercamp, Hugues Decrombecque, Christine Tessier, Claude Coureau, Benoit Bortolussi, Sylvain Gerbaud, Gilles Bompeix, André Marcone, Franck Lagasse, Philippe Seguy, Thierry Clos, Philippe Dupuis, Bertrand Bucher, Jacques Malagie, Florence Gressier, Patrick Tessier, Jordi Gine et Christian Larrigaudière, « Évaluation et mise au point de méthodes alternatives aux traitements chimiques après-récolte permettant de lutter contre l'échaudure de prématurité des pommes sans dégradation de la qualité », Innovations Agronomiques, 2016, pp. 281-295
Christophe Aubert, « Les sociétés secrètes en Anjou au dix-neuvième siècle », Marque page, N° 42, 2009, p. 3
Christophe Aubert, « Origines et évolutions des mécanismes de solidarité en droit public et privé », Revue juridique de l'Ouest, 2008, p. NC
Christophe Aubert, « Gendarmerie et transition(s) politique(s) au XIXe siècle », Annales de Bretagne et des pays de l'Ouest : Anjou, Maine, Touraine, N° 2, 2007, pp. 103-194
Christophe Aubert, « Les missions politiques de la gendarmerie en Maine-et-Loire sous la monarchie de Juillet et le Second Empire », Annales de Bretagne et des pays de l'Ouest : Anjou, Maine, Touraine, N° 2, 2007, pp. 121-133
Christophe Aubert et Michel Pitrat, « Volatile compounds in the skin and pulp of Queen Anne's pocket melon », Journal of Agricultural and Food Chemistry, N° 21, 2006, pp. 8177-8182
Christophe Aubert, « Le harcèlement au travail : l'état du droit et les voies d'action », Revue juridique de l'Ouest, N° 1, 2005, pp. 75-105
Christophe Aubert, « Attroupements républicains à Saumur : les affaires Mars-Larivière et de Castellane mars 1848-avril 1850 », Société des Lettres, Sciences et Arts du Saumurois, N° 149, 2000, pp. 61-71
Christophe Aubert, « Les sociétés secrètes politiques à Saumur sous la Restauration (1815-1822) », Société des Lettres, Sciences et Arts du Saumurois, N° 148, 1999, pp. 41-56
Autre
Christophe Aubert, Muriel Guyard-Nicodème, Marc Tabouret, Adeline Huneau-Salaün, Louise Baugé, Ségolène Quesne, Christian Baudry, Marine Voisine, Marianne Chemaly et Laetitia Bonifait, Les poly-élevages volailles-bovins : des élevages à risques pour la présence et la circulation de Campylobacter et Salmonella ?, p. NC
