Thèse
La répression des infractions à l'ordre moral sous le régime de Vichy, 1940-1944. Thèse soutenue en 2005 à Lyon 3, sous la direction de Christian Bruschi.
Ouvrages
Marc Boninchi et Jean-Pierre Le Crom (dir.), La chicotte et le pécule : les travailleurs à l'épreuve du droit colonial français (XIXe-XXe siècles), Presses universitaires de Rennes, 2021, Histoire, 332 p. 
Marc Boninchi, Catherine Fillon et Arnaud Lecompte, Devenir juge : modes de recrutement et crise des vocations de 1830 à nos jours, Presses universitaires de France, 2008, Droit et justice, 302 p.
Marc Boninchi, Catherine Fillon et Arnaud Lecompte (dir.), Devenir juge, pourquoi, comment ? : rapport final, GIP Mission de recherche Droit et Justice, 2006, 348 p.
Marc Boninchi, Vichy et l'ordre moral, Presses universitaires de France, 2005, 318 p.
Marc Boninchi (dir.), Pouvoir et société en temps de crise : actes du colloque de Lyon, 18 et 19 décembre 2002, Perspectives juridiques, 2003, Collection Colloques, 369 p.
Articles
Marc Boninchi et Boninchi Marc, « Un notable homosexuel face à la justice et aux autorités universitaires (Lyon, automne 1940) », in Maryse Baudrez et Thierry di Manno (dir.), Les sexualités, répression, tolérance, indifférence, Bruylant, 2012, p. 147
Marc Boninchi et Boninchi Marc, « Une justice "ordinaire" : à propos d'un jugement du tribunal correctionnel de Lyon (8 septembre 1941) », Voyages en l'honneur du Professeur Geneviève Koubi, un droit à l'évasion... circulaire, lextenso - l'épitoge, 2012, p. 211
Marc Boninchi, Boninchi Marc et Mathieu Touzeil-Divina, « Des premiers docteurs en droit de l'université française (1809-1850) », in Jean-Louis Halpérin (dir.), Paris, capitale juridique (1804-1950), Editions rue d'Ulm, 2011, p. 193
Marc Boninchi et Boninchi Marc, « Notice "Histoire du Droit », in Mathieu Touzeil-Divina (dir.), Initiation au droit, introduction encyclopédique aux études et métiers juridiques, LGDJ, lextenso, 2011, p. 139
Marc Boninchi et Boninchi Marc, « La répression judiciaire de l'homosexualité : le contexte législatif », La déportation pour motif d'homosexualité en France, débats d'histoire et enjeux de mémoire, Mémoire active, 2010, p. 73
Marc Boninchi et Boninchi Marc, « Le code de la Famille de 1939 et la répression des infractions à l'ordre moral », Passé et présent du droit, 2009, p. 205
Autres
Marc Boninchi et Boninchi Marc, Compte-rendu de "TOUZEIL-DIVINA Mathieu, Eléments d'histoire de l'enseignement du droit public : la contribution du doyen Foucart (1799-1860), Paris : LGDJ, 2007", in Droit et Société 2009/3, n° 73, p. 790
Marc Boninchi, Jean-Pierre Le Crom, Philippe Auvergnon, Katia Barragan, Dominique Blonz-Colombo, Ariane Clément, Stéphanie Couderc-Morandeau, Delphine Connes, Bruno Dubois, Augustin Emane, Silvia Falconieri, Farid Lekéal, Sandra Gérard-Loiseau, Corinne Pernet, Florence Renucci et Dominique Taurisson-Mouret, Histoire du droit du travail dans les colonies françaises (1848-1960), p. NC
