Philippe Jacques

Actualités scientifiques

Parution

États de droits

19 oct. 2023

Parution

Les objets juridiques

7 juil. 2020

Parution

Mélanges offerts à Geneviève Pignarre

29 oct. 2018

Publications scientifiques

• Thèse

  THESE
  Regards sur l'article 1135 du Code civil, soutenue en 2003 à Paris 12 sous la direction de François Chabas 

  Les applications de cet article font l'objet d'une attention doctrinale soutenue, non le procédé en jeu. Cette thèse lui est donc consacrée. Elle souligne que l'accord de volontés n'est pas la convention. Le passage de l'un à l'autre résulte d'un mécanisme "d'appréciation". Cela distingue cet article des règles d'interprétation et de l'article 1134, alinéa 3. L'article 1135 emporte des effets complétifs, effets inexprimés, complémentaires et accessoires qui ne procèdent pas de la volonté des parties, mais des sources d'obligations que sont la loi, la norme coutumière et l'équité. Ils visent à inscrire de simples accords dans l'environnement normatif auquel ils doivent leur force obligatoire. Pour devenir convention, il ne suffit donc pas qu'un accord soit légalement formé; il faut encore qu'il soit légalement composé. Cette mise en conformité (par voie d'ajout) avec les exigences du droit positif du contenu de accords de volontés est l'office caractéristique de cet article.

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• Ouvrages

  Philippe Jacques, Le principe d'égalité des belligérants dans les conflits armés non internationaux, Bruylant, 2026, Collection de droit international, 503 p.  

  Philippe Jacques (dir.), Être parent aujourd'hui, Dalloz, 2010, Thèmes et commentaires, 141 p.   

  Philippe Jacques, François Chabas, Regards sur l'article 1135 du Code civil, 2003, 882 p. 

  Les applications de cet article font l'objet d'une attention doctrinale soutenue, non le procédé en jeu. Cette thèse lui est donc consacrée. Elle souligne que l'accord de volontés n'est pas la convention. Le passage de l'un à l'autre résulte d'un mécanisme "d'appréciation". Cela distingue cet article des règles d'interprétation et de l'article 1134, alinéa 3. L'article 1135 emporte des effets complétifs, effets inexprimés, complémentaires et accessoires qui ne procèdent pas de la volonté des parties, mais des sources d'obligations que sont la loi, la norme coutumière et l'équité. Ils visent à inscrire de simples accords dans l'environnement normatif auquel ils doivent leur force obligatoire. Pour devenir convention, il ne suffit donc pas qu'un accord soit légalement formé; il faut encore qu'il soit légalement composé. Cette mise en conformité (par voie d'ajout) avec les exigences du droit positif du contenu de accords de volontés est l'office caractéristique de cet article.

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• Chapitres d'ouvrage

  Philippe Jacques, Areski Flissi, Matthieu Duban, Valérie Leclère, Maude Pupin, « Norine: Bioinformatics Methods and Tools for the Characterization of Newly Discovered Nonribosomal Peptides », in Michael Burkart, Fumihiro Ishikawa (dir.), Non-Ribosomal Peptide Biosynthesis and Engineering. Methods and Protocols :, Springer US, 2023   

  Philippe Jacques, Heykel Trabelsi, Debarun Dhali, Yazen Yaseen, Valérie Leclère, « Bacillus subtilis-based microbial cell factories », Microbial Cell Factories Engineering for Production of Biomolecules :, Elsevier, 2021 

  Philippe Jacques, Catherine Petit-Aupert, Christophe Chabrié, Michel Daynès, Brieuc Fages, « Les villae du Haut-Empire (Ier-IIIe s. ap. J.-C.) », in Catherine Petit-Aupert (dir.), Habiter en Aquitaine dans l’Antiquité, de la Tène finale à l’Antiquité tardive, catalogue d’exposition :, Ausonius, 2018, pp. 48-55 

  Philippe Jacques, Philippe Brun, « Ebauche d’un dictionnaire inamoureux de la réforme du droit des contrats », Mélanges en l’honneur du professeur Geneviève Pignarre. Un droit en perpétuel mouvement :, LGDJ Lextenso, 2018, pp. 149 

  Philippe Jacques, Catherine Petit-Aupert, Frédéric Berthault, Brieuc Fages, François Réchin, « Les productions viticoles », in Catherine Petit-Aupert (dir.), Habiter en Aquitaine dans l’Antiquité, de la Tène finale à l’Antiquité tardive, catalogue d’exposition :, Ausonius, 2018 

  Philippe Jacques, Valérie Leclère, Tilmann Weber, Maude Pupin, « Bioinformatics Tools for the Discovery of New Nonribosomal Peptides », in Bradley S. Evans (dir.), Nonribosomal Peptide and Polyketide Biosynthesis :, Humana Press, 2016 

• Préfaces / Postfaces

  Philippe Jacques, préface à Flora Vern, Les objets juridiques: recherches en droit des biens, Dalloz, 2020, Nouvelle Bibliothèque de Thèses, 878 p.   

  Les biens ne semblent exister que pour être classés, distingués et appropriés, mais ne sont guère envisagés indépendamment des droits réels qui s’y rapportent. Or, la multiplication pléthorique des droits réels pourrait bien révéler la diversité des objets possibles du droit réel. Ces objets ne sont pas des choses du monde extérieur, mais une réalité abstraite que le droit construit au terme d’une opération de qualification: ce sont des objets juridiques, parce qu’ils sont déjà envisagés par le droit objectif à l’occasion de l’application d’une règle de droit positif qui impose l’appréciation de certains éléments de fait propres à en révéler l’existence. Le droit objectif construit donc une réalité qui lui est propre, avant même qu’il soit fait référence à un éventuel droit réel. Pour autant, la technique juridique n’est jamais inerte. Il existe des mécanismes permettant à la volonté de modifier la consistance ou l’affectation des objets juridiques et, partant, d’agir sur le régime des biens. Ces opérations sont à la fois caractéristiques et spécifiques de la technique du droit réel, employée pour façonner la réalité que perçoit le droit objectif. Les prétentions subjectives à la jouissance des objets juridiques rejaillissent, cependant, sur la conception que l’on se fait du droit réel, au point d’occulter sa dimension technique derrière les prérogatives qu’il semble conférer aux sujets de droit.

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  Philippe Jacques, préface à Tarik Lakssimi, La summa divisio des droits réels et des droits personnels: étude critique, Dalloz, 2016, Nouvelle Bibliothèque de Thèses, 292 p.   

  Il est devenu commun, pour la doctrine civiliste, de présenter la scène juridique par la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Les premiers permettent aux personnes d'exercer leur domination sur le monde des choses, tandis que les seconds constituent des liens de droit entre personnes – des obligations. Si la structure du droit réel apparaît, ainsi, comme un lien direct entre une personne et une chose, celle du droit personnel souffre la présence d'un débiteur, contre lequel s'exerce le droit. La doctrine considère que cette opposition structurelle des droits réels et des droits personnels se traduit, concrètement, par une différence de régime au profit du droit réel : ce dernier serait supérieur au droit personnel, du fait, notamment, de la plus grande efficacité de son régime de protection. Or, la thèse donne d'abord l'occasion de constater que cette hiérarchie dans le régime de protection des droits réels et des droits personnels ne trouve aucun fondement en droit positif. En conséquence, dès lors que la différence de régime des droits réels et des droits personnels est présentée par la doctrine comme la traduction de l'opposition structurelle de ces droits, la pertinence de cette classification structurelle apparaît douteuse. Pour autant, la thèse conduira à la conservation de la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Ce maintien requiert, néanmoins, de modifier le critère de distinction qui organise actuellement la summa divisio, à savoir la prétendue supériorité du droit réel sur le droit personnel. Le plan suivi pour cette démonstration est le suivant : I : L'origine de la summa divisio II : Les incohérences de la summa divisio III : La correction de la summa divisio

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• Articles

  Aline Leconte, Justine Jacquin, Matthieu Duban, Caroline Deweer, Pauline Trapet, « Deciphering the mechanisms involved in reduced sensitivity to azoles and fengycin lipopeptide in Venturia inaequalis », Microbiological Research, Elsevier, 2024 

  Emma Dutilloy, Anthony Arguëlles Arias, Nicolas Richet, Jean-François Guise, Matthieu Duban, « Bacillus velezensis BE2 controls wheat and barley diseases by direct antagonism and induced systemic resistance », Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2024, n°1, pp. 18-24   

  Amel El Arbi, Ségolène Arnauld, Gabrielle Chataigné, Didier Lecouturier, Alexandre Bricout, « Lipopeptide culture filtrates from Bacillus spp. provide effective protection to wheat against the foliar pathogen Zymoseptoria tritici », Journal of Applied Microbiology, Wiley, 2024, n°1 

  Simon Stier, Christoph Kreisbeck, Holger Ihssen, Matthias Popp, Jens Hauch, « Materials Acceleration Platforms (MAPs) accelerating materials research and development to meet urgent societal challenges », Advanced Materials, Wiley-VCH Verlag, 2024, n°45   

  Philippe Jacques, « Le réméré, où cent fois sur le métier remettez votre ouvrage… », Recueil Dalloz, Dalloz , 2023, n°34, p. 1781  

  Anca Lucau-Danila, Raymonde Baltenweck, Alessandra Maia-Grondard, Pauline Trapet, Maryline Magnin-Robert, « Deciphering immune responses primed by a bacterial lipopeptide in wheat towards Zymoseptoria tritici », Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2023   

  Aline Leconte, Ludovic Tournant, Jérôme Muchembled, Jonathan Paucellier, Arnaud Héquet, « Assessment of Lipopeptide Mixtures Produced by Bacillus subtilis as Biocontrol Products against Apple Scab (Venturia inaequalis) », Microorganisms, MDPI, 2022, n°9, p. 1810   

  Barbara Fifani, Sebastien Steels, Catherine Helmus, Alice Delacuvellerie, Barbara Deracinois, « Coculture of Trichoderma harzianum and Bacillus velezensis Based on Metabolic Cross-Feeding Modulates Lipopeptide Production », Microorganisms, MDPI, 2022   

  Jean-Sébastien Guez, Françoise Coucheney, Joany Guy, Max Béchet, Pierre Fontanille, « Bioinformatics modelling and metabolic engineering of thebranched chain amino acid pathway for specific production of mycosubtilin isoforms in Bacillus subtilis », Metabolites, MDPI, 2022, n°2, p. 107   

  Nour El Houda Raouani, Elodie Claverie, Béatrice Randoux, L. Chaveriat, Yazen Yaseen, « Bio-Inspired Rhamnolipids, Cyclic Lipopeptides and a Chito-Oligosaccharide Confer Protection against Wheat Powdery Mildew and Inhibit Conidia Germination », Molecules, MDPI, 2022, n°19, p. 6672   

  Alexandre Bricout, Charlotte Chandeysson, Matthieu Duban, Corinne Boistel, Gabrielle Chataigné, « The diversity of lipopeptides in the Pseudomonas syringae complex parallels phylogeny and sheds light on structural diversification during evolutionary history », Microbiology Spectrum, American Society for Microbiology, 2022, n°6   

  Philippe Jacques, Antoine Vassaux, Marie Rannou, Soline Peers, Théo Daboudet, « Impact of the Purification Process on the Spray-Drying Performances of the Three Families of Lipopeptide Biosurfactant Produced by Bacillus subtilis », Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Frontiers, 2021   

  Grégory Hoff, Anthony Arguelles Arias, Farah Boubsi, Jelena Pršić, Thibault Meyer, « Surfactin Stimulated by Pectin Molecular Patterns and Root Exudates Acts as a Key Driver of the Bacillus -Plant Mutualistic Interaction », mBio, American Society for Microbiology, 2021, n°6   

  Ariane Théatre, Carolina Cano-Prieto, Marco Bartolini, Yoann Laurin, Magali Deleu, « The surfactin-like lipopeptides from Bacillus spp.: natural biodiversity and synthetic biology for a broader application range », Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Frontiers, 2021   

  Philippe Jacques, Antoine Vassaux, Christian Larroche, François Coutte, « New Continuous Process for the Production of Lipopeptide Biosurfactants in Foam Overflowing Bioreactor », Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Frontiers, 2021   

  Philippe Jacques, Dorra Ben Abdallah, Francois Krier, Slim Tounsi, « Agrobacterium tumefaciens C58 presence affects Bacillus velezensis 32a ecological fitness in the tomato rhizosphere », Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2020, n°22 

  Pierre Tocquin, Luc Cornet, Damien Sirjacobs, Valérie Leclère, Maude Pupin, « Palantir: a springboard for the analysis of secondary metabolite gene clusters in large-scale genome mining projects », Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2020, n°15 

  Philippe Jacques, Hannah Luise Brück, François Coutte, Pascal Dhulster, Sébastien Gofflot, « Growth Dynamics of Bacterial Populations in a Two-Compartment Biofilm Bioreactor Designed for Continuous Surfactin Biosynthesis », Microorganisms, MDPI, 2020, n°5, p. 679   

  Antoine Vassaux, Loic Meunier, Micheline Vandenbol, Denis Baurain, Patrick Fickers, « Nonribosomal peptides in fungal cell factories: from genome mining to optimized heterologous production », Biotechnology Advances, Elsevier, 2019, n°8, pp. 1-23   

  Philippe Jacques, Mickael Chevalier, Emma Ricart, Emeline Hanozin, Maude Pupin, « Kendrick Mass Defect Approach Combined to NORINE Database for Molecular Formula Assignment of Nonribosomal Peptides », Journal of The American Society for Mass Spectrometry, American Chemical Society, 2019, n°12 

  Hélène Desmyttere, Caroline Deweer, Jérôme Muchembled, Karin Sahmer, Justine Jacquin, « Antifungal Activities of Bacillus subtilis Lipopeptides to Two Venturia inaequalis Strains Possessing Different Tebuconazole Sensitivity », Frontiers in Microbiology, Frontiers Media, 2019   

  Philippe Jacques, Oumaima Zouari, Alice Rochex, Gabrielle Chataigné, Pascal Dhulster, « Bio-emulsifying and biodegradation activities of syringafactin producing pseudomonas spp. strains isolated from oil contaminated soils », Biodegradation, Springer Verlag, 2019, n°4 

  Philippe Jacques, Antoine Vassaux, Cedric Tarayre, Anthony Arguelles-Arias, Philippe Compère, « Astin c production by the endophytic fungus cyanodermella asteris in planktonic and immobilized culture conditions », Biotechnology Journal, Wiley-VCH Verlag, 2019, n°8, pp. 1-11 

  Areski Flissi, Emma Ricart, Clémentine Campart, Mickael Chevalier, Yoann Dufresne, « Norine: update of the nonribosomal peptide resource », Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2019   

  Philippe Jacques, Hannah Luise Bruck, Frank Delvigne, Pascal Dhulster, « Molecular strategies for adapting Bacillus subtilis 168 biosurfactant production to biofilm cultivation mode », Bioresource Technology, Elsevier, 2019   

  Samara Mejri, Ali Siah, François Coutte, Maryline Magnin-Robert, Béatrice Randoux, « Biocontrol of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici using cyclic lipopeptides from Bacillus subtilis », Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2018, n°30 

  Philippe Jacques, Yazen Yaseen, Awa Diop, Frédérique Gancel, Max Béchet, « Polynucleotide phosphorylase is involved in the control of lipopeptide fengycin production in Bacillus subtilis », Archives of Microbiology, Springer Verlag, 2018, n°5 

  Lamia Abdellaziz, Marlène Chollet, Ahmed Abderrahmani, Max Béchet, Lamia Yaici, « Lipopeptide biodiversity in antifungal Bacillus strains isolated from Algeria », Archives of Microbiology, Springer Verlag, 2018, n°8 

  Francois Coutte, Didier Lecouturier, Krasimir Dimitrov, Jean-Sébastien Guez, Frank Delvigne, « Microbial lipopeptide production and purification bioprocesses, current progress and future challenges », Biotechnology Journal, Wiley-VCH Verlag, 2017, n°7 

  Philippe Jacques, Qassim Esmaeel, Maude Pupin, Valérie Leclère, « Nonribosomal peptides and polyketides of Burkholderia: new compounds potentially implicated in biocontrol and pharmaceuticals », Environmental Science and Pollution Research, Springer Verlag, 2017 

  , « Genetic and functional analyses of krs, a locus encoding kurstakin, a lipopeptide produced by Bacillus thuringiensis », Research in Microbiology, Elsevier, 2017, n°4 

  Debarun Dhali, François Coutte, Anthony Argüelles Arias, Sandrine Auger, Vladimir Bidnenko, « Genetic engineering of the branched fatty acid metabolic pathway of Bacillus subtilis for the overproduction of surfactin C14 isoform », Biotechnology Journal, Wiley-VCH Verlag, 2017, n°7, p. 23 

  Philippe Jacques, Alexandre Ceugniez, Bernard Taminiau, Veronique Delcenserie, Georges Daube, « Use of a metagenetic approach to monitor the bacterial microbiota of Tomme d'Orchies cheese during the ripening process », International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2017, pp. 65-69 

  Alexandre Ceugniez, Melissa Tourret, Elodie Dussert, Francoise Coucheney, Barbara Deracinois, « Interactions between Kluyveromyces marxianus from cheese origin and the intestinal symbiont Bacteroides thetaiotaomicron: Impressive antioxidative effects », LWT - Food Science and Technology, Elsevier, 2017   

  Philippe Jacques, Alexandre Ceugniez, Bernard Taminiau, Françoise Coucheney, Veronique Delcenserie, « Fungal diversity of Tomme d'Orchies cheese during the ripening process as revealed by a metagenomic study », International Journal of Food Microbiology, Elsevier, 2017, pp. 89-93 

  Philippe Jacques, Alexandre Ceugniez, Françoise Coucheney, Georges Daube, Veronique Delcenserie, « Anti-Salmonella activity and probiotic trends of Kluyveromyces marxianus S-2-05 and Kluyveromyces lactis S-3-05 isolated from a French cheese, Tomme d'Orchies », Research in Microbiology, Elsevier, 2017, n°6 

  Augusto Etchegaray, François Coutte, Gabrielle Chataigné, Max Béchet, Ramon H.Z. dos Santos, « Production of Bacillus amyloliquefaciens OG and its metabolites in renewable media: valorisation for biodiesel production and p -xylene decontamination », Canadian Journal of Microbiology, NRC Research Press, 2017, n°1, pp. 46-60 

  Philippe Jacques, Joachim Niehren, Cristian Versari, Mathias John, François Coutte, « Predicting Changes of Reaction Networks with Partial Kinetic Information », BioSystems, Elsevier, 2016   

  Luiz Fernando Motta dos Santos, François Coutte, Rozenn Ravallec, Pascal Dhulster, Lucie Tournier-Couturier, « An improvement of surfactin production by B. subtilis BBG131 using design of experiments in microbioreactors and continuous process in bubbleless membrane bioreactor », Bioresource Technology, Elsevier, 2016 

  Philippe Jacques, Thibaut Masy, Sandrine Demanèche, Olivier Tromme, Philippe Thonart, « Hydrocarbon biostimulation and bioaugmentation in organic carbon and clay-rich soils », Soil Biology and Biochemistry, Elsevier, 2016, pp. 66-74 

  Qassim Esmaeel, Maude Pupin, Nam Phuong Kieu, Gabrielle Chataigné, Max Béchet, « Burkholderia genome mining for nonribosomal peptide synthetases reveals a great potential for novel siderophores and lipopeptides synthesis », MicrobiologyOpen, Wiley, 2016, n°3   

  Philippe Jacques, Alexandre Dehaut, Frédéric Krzewinski, Thierry Grard, Marlène Chollet, « Monitoring the freshness of fish: development of a qPCR method applied to MAP chilled whiting », Journal of the Science of Food and Agriculture, Wiley, 2016, n°6   

  Naima Arroume, Rénato Froidevaux, Romain Kapel, Benoit Cudennec, Rozenn Ravallec, « Food peptides: purification, identification and role in the metabolism », Current Opinion in Food Science, Elsevier, 2016   

  Philippe Jacques, Qassim Esmaeel, Mickael Chevalier, Gabrielle Chataigne, Rathinasamy Subashkumar, « Nonribosomal peptide synthetase with a unique iterative-alternative-optional mechanism catalyzes amonabactin synthesis in Aeromonas », Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2016, n°19 

  Thomas Dubois, Karoline Faegri, Sébastien Gélis-Jeanvoine, Stéphane Perchat, Christelle Lemy, « Correction: necrotrophism Is a quorum-sensing-regulated lifestyle in Bacillus thuringiensis », PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2016, n°11   

  Amel El Arbi, Gabrielle Chataigné, Max Béchet, Didier Lecouturier, Ségolène Arnauld, « The Tunisian oasis ecosystem is a source of antagonistic Bacillus spp. producing diverse antifungal lipopeptides », Research in Microbiology, Elsevier, 2016, n°1, pp. 46-57 

  Philippe Jacques, Maude Pupin, Qassim Esmaeel, Areski Flissi, Yoann Dufresne, « Norine: a powerful resource for novel nonribosomal peptide discovery », Synthetic and Systems Biotechnology, KeAi, 2015   

  Chien-Jui Huang, Ellen Pauwelyn, Marc Ongena, Delphine Debois, Valérie Leclère, « Characterization of Cichopeptins, New Phytotoxic Cyclic Lipodepsipeptides Produced by Pseudomonas cichorii SF1-54 and Their Role in Bacterial Midrib Rot Disease of Lettuce », Molecular Plant-Microbe Interactions, The American Phytopathological Society, 2015, n°9 

  François Coutte, Joachim Niehren, Debarun Dhali, Mathias John, Cristian Versari, « Modeling Leucine’s Metabolic Pathway and Knockout Prediction Improving the Production of Surfactin, a Biosurfactant from Bacillus Subtilis », Biotechnology Journal, Wiley-VCH Verlag, 2015, n°8   

  Philippe Jacques, Sabrina Chandler, Nathalie van Hese, François Coutte, Monica Höfte, « Role of cyclic lipopeptides produced by Bacillus subtilis in mounting induced immunity in rice (Oryza sativa L.) », Physiological and Molecular Plant Pathology, Elsevier, 2015, pp. 20-30 

  Wissal Wannoussa, Serge Hiligsmann, Ludivine Tasseroul, Stéphanie D. Lambert, Benoît Heinrichs, « Amélioration de la biodégradation du biphényle par Rhodococcus erythropolis t902.1 en présence de Fe2O3 et de nanoparticules de fer encapsulées dans un xérogel de silice », Environnement, Ingénierie & Développement, Episciences, 2015, pp. 33-40   

  Giovanni Farace, Olivier Fernandez, Lucile Jacquens, François Coutte, François Krier, « Cyclic lipopeptides from Bacillus subtilis activate distinct patterns of defence responses in grapevine », Molecular Plant Pathology, Wiley, 2015, n°2   

  Areski Flissi, Yoann Dufresne, Juraj Michalik, Laurie Tonon, Stéphane Janot, « Norine, the knowledgebase dedicated to non-ribosomal peptides, is now open to crowdsourcing », Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2015   

  Jolien d'Aes, Nam Phuong Kieu, Valérie Leclère, Caroline Tokarski, Feyisara Eyiwumi Olorunleke, « To settle or to move? The interplay between two classes of cyclic lipopeptides in the biocontrol strain P seudomonas CMR12a », Environmental Microbiology, Society for Applied Microbiology and Wiley-Blackwell, 2014, n°7 

  Jovana Deravel, Sébastien Lemière, François Coutte, François Krier, Nathalie van Hese, « Mycosubtilin and surfactin are efficient, low ecotoxicity molecules for the biocontrol of lettuce downy mildew », Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2014, n°14 

  Thibault Caradec, Maude Pupin, Aurélien Vanvlassenbroeck, Marie-Dominique Devignes, Malika Smaïl-Tabbone, « Prediction of Monomer Isomery in Florine: A Workflow Dedicated to Nonribosomal Peptide Discovery », PLoS ONE, Public Library of Science, 2014, n°1, p. 85667   

  Philippe Jacques, Ammar Abdo, Valérie Leclère, Naomie Salim, Maude Pupin, « Prediction of New Bioactive Molecules using a Bayesian Belief Network », Journal of Chemical Information and Modeling, American Chemical Society, 2014, n°1, pp. 30-36   

  Philippe Jacques, Ellen Pauwelyn, Chien-Jui Huang, Marc Ongena, Valérie Leclère, « New Linear Lipopeptides Produced by Pseudomonas cichorii SF1-54 Are Involved in Virulence, Swarming Motility, and Biofilm Formation », Molecular Plant-Microbe Interactions, The American Phytopathological Society, 2013, n°5 

  Philippe Jacques, Sameh Fahima, Krasimir Dimitrov, Peggy Vauchel, Frédérique Gancel, « Oxygen transfer in three phase inverse fluidized bed bioreactor during biosurfactant production by Bacillus subtilis », Biochemical Engineering Journal, Elsevier, 2013, pp. 70-76 

  Max Béchet, Joany Castéra-Guy, Jean-Sebastien Guez, Nour-Eddine Chihib, Françoise Coucheney, « Production of a novel mixture of mycosubtilins by mutants of Bacillus subtilis », Bioresource Technology, Elsevier, 2013   

  Philippe Jacques, François Coutte, Didier Lecouturier, Valérie Leclère, Max Béchet, « New integrated bioprocess for the continuous production, extraction and purification of lipopeptides produced by Bacillus subtilis in membrane bioreactor », Process Biochemistry, Elsevier, 2013, n°1, pp. 25-32 

  Philippe Jacques, Paula Jauregi, François Coutte, Lucie Catiau, Didier Lecouturier, « Micelle size characterization of lipopeptides produced by B. subtilis and their recovery by the two-step ultrafiltration process », Separation and Purification Technology, Elsevier, 2013 

  Ian Hamley, Ashkan Dehsorkhi, Paula Jauregi, Jani Seitsonen, Janne Ruokolainen, « Self-assembly of three bacterially-derived bioactive lipopeptides », Soft Matter, Royal Society of Chemistry, 2013, n°40, p. 9572 

  Philippe Jacques, Ammar Hasan Abdo, Ségolène Caboche, Valérie Leclère, « A new fingerprint to predict nonribosomal peptides activity. », Journal of Computer-Aided Molecular Design, Springer Verlag, 2012, n°10   

  Max Béchet, Thibault Caradec, Walaa Hussein, Ahmed Abderrahmani, Marlène Chollet, « Structure, biosynthesis, and properties of kurstakins, nonribosomal lipopeptides from Bacillus spp. », Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2012, n°3   

  Thomas Dubois, Karoline Faegri, Stephane Perchat, Christelle Lemy, Christophe Buisson, « Necrotrophism is a quorum-sensing-regulated lifestyle in [i]Bacillus thuringiensis[/i] », PLoS Pathogens, Public Library of Science, 2012, n°4   

  Philippe Jacques, Mehmet Nail Nasir, Emmanuel Benichou, Jean-Sebastien Guez, Pierre-François Brevet, « Second Harmonic Generation to Monitor the Interactions of the Antimicrobial Mycosubtilin with Membrane-Mimicking Interfacial Monolayers », BioNanoScience, Springer, 2012, n°2   

  Philippe Jacques, Jean Sébastien Guez, François Coutte, Komi Midzodzi Pekpe, Jean Philippe Cassar, « Control of the specific growth rate of Bacillus subtilis for the production of biosurfactant lipopeptides in bioreactors with foam overflow », Process Biochemistry, Elsevier, 2010, n°11   

  Philippe Jacques, Ségolène Caboche, Valérie Leclère, Gregory Kucherov, « Diversity of monomers in nonribosomal peptides: towards the prediction of origin and biological activity. », Journal of Bacteriology, American Society for Microbiology, 2010, n°19   

  François Coutte, Didier Lecouturier, Saliha Ait Yahia, Valérie Leclère, Max Béchet, « Production of surfactin and fengycin by Bacillus subtilis in a bubbleless membrane bioreactor », Applied Microbiology and Biotechnology, Springer Verlag, 2010, n°2 

  François Coutte, Valérie Leclère, Max Béchet, Jean-Sebastien Guez, Didier Lecouturier, « Effect of pps disruption and constitutive expression of srfA on surfactin productivity, spreading and antagonistic properties of Bacillus subtilis 168 derivatives », Journal of Applied Microbiology, Wiley, 2010, n°2   

  Philippe Jacques, Pascale Deumier, « Sources du droit en droit interne », RTDCiv. Revue trimestrielle de droit civil, Dalloz , 2009, n°1, pp. 77-89 

  Philippe Jacques, Parvin Shakerifard, Frédéric Gancel, Christine Faille, « Effect of different Bacillus subtilis lipopeptides on surface hydrophobicity and adhesion of Bacillus cereus 98/4 spores to stainless steel and Teflon », Biofouling, Taylor & Francis, 2009, n°6 

  Philippe Jacques, Maude Pupin, Valérie Leclère, Gregory Kucherov, « Structural pattern matching of nonribosomal peptides. », BMC Structural Biology, BioMed Central, 2009, n°15   

  Philippe Jacques, François Coutte, Anne-Sophie Drucbert, Pierre-Marie Danzé, « Resistance of the cell wall to degradation is a critical parameter for isolation of high quality RNA from natural isolates of Bacillus subtilis », Archives of Microbiology, Springer Verlag, 2009   

  Patrick Fickers, Jean-Sebastien Guez, Christian Damblon, Valérie Leclère, Max Béchet, « High-Level Biosynthesis of the Anteiso-C17 Isoform of the Antibiotic Mycosubtilin in Bacillus subtilis and Characterization of Its Candidacidal Activity », Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2009, n°13   

  Philippe Jacques, « D'adage en général et de l'interprétation stricte en particulier », RTDCiv. Revue trimestrielle de droit civil, Dalloz , 2008, n°03, p. 431  

  Philippe Jacques, « Pouvoirs : la lutte continue », RTDCiv. Revue trimestrielle de droit civil, Dalloz , 2008, n°01, p. 66  

  Patrick Fickers, Valérie Leclère, Jean-Sebastien Guez, Max Béchet, Françoise Coucheney, « Temperature dependence of mycosubtilin homologue production in Bacillus subtilis ATCC6633 », Research in Microbiology, Elsevier, 2008   

  Philippe Jacques, Maude Pupin, Valérie Leclère, Arnaud Fontaine, Gregory Kucherov, « NORINE: a database of nonribosomal peptides. », Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2008   

  Philippe Jacques, « De la distinction des genres : contrat légalement formé et législation contractuellement présentée. », RTDCiv. Revue trimestrielle de droit civil, Dalloz , 2007, n°03, p. 503  

  Philippe Jacques, « Départ de M. Canivet et installation de M. Lamanda à la présidence de la Cour de cassation : l'heure d'un bilan sans heur », RTDCiv. Revue trimestrielle de droit civil, Dalloz , 2007, n°03, p. 514  

  Philippe Jacques, Frédérique Gancel, Marlène Chollet-Imbert, Jean-Sebastien Guez, Max Béchet, « La synthèse peptidique non-ribosomique, source de biodiversité de composés actifs. », Bulletin de la Société Française Microbiologie, , 2007 

  Valérie Leclère, Max Béchet, Akram Adam, Jean-Sebastien Guez, Bernard Wathelet, « Mycosubtilin Overproduction by Bacillus subtilis BBG100 Enhances the Organism's Antagonistic and Biocontrol Activities », Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2005   

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Jean-Philippe Cassar, « Etude d’un bioprocédé en réacteur semi-discontinu accompagné de pertes par moussage : application à l’extraction de tensioactifs lipopeptidiques produits par Bacillus subtilis. », Récents Progrès en Génie des Procédés, Lavoisier, 2005 

  Philippe Jacques, Catherine Balmelle, Dany Barraud, Béatrice Duprat, Hervé Gaillard, « La viticulture antique en Aquitaine », Gallia - Archéologie de la France antique, CNRS Éditions, 2001   

  Philippe Jacques, Daniel Andre, « La certification des produits et des personnels en anticorrosion : La création de l'ACQPA, organisme certificateur des produits et des personnels en anticorrosion : Note technique », BLPC - Bulletin des Laboratoires des Ponts et Chaussées, , 1996, n°206   

• Autres publications

  Simon Stier, Christoph Kreisbeck, Holger Ihssen, Matthias Albert Popp, Jens Hauch, The Significance of Accelerated Discovery of Advanced Materials to address Societal Challenges, 2023 

• Communications

  Francesco Roppo, Joachim Niehren, Florian Chemarin, Nastassia Kaugarenia, Sigrid Görgen, « Advancing Lignocellulosic Biomass Conversion into Lipopeptides throughKnowledge-Driven B. subtilis Engineering », Advanced Fermentation Technology, Lille, prévue le 30 juin 2026 

  Philippe Jacques, Florence Verdin, Richard Lopes, « La production du sel sur la côte aquitaine, une activité étroitement dépendante de son environnement », Les économies vivrières dans l'Europe du Fer : Production et consommation de la montagne à la côte, Lleida Spain, le 15 mai 2025 

  Philippe Jacques, Fernanda Jorge, Orynbek Nurdana A, Abduraimova Aiganym A, Valakhanovich Anastasiya A, « Biotechnological production of 2-phenylethanol from agro-industrial wastes for foods and flavouring applications », 32nd European Biomass Conference & Exhibition, Marseille (FR), le 24 juin 2024 

  Sorphea Heang Madlener, Alice Rochex, Alexandre Bricout, Angeline Pelus, Cindy E. Morris, « Potential of lipopeptide-producing Pseudomonas syringae strains for biocontrol », 75th International Symposium on Crop Protection (ISCP), Ghent Belgium, le 21 mai 2024 

  Barbara Deracinois, Camille Dugardin, Ikram Benneceur, Esteban Marechal, Jacques Neuray, « Highlighting the antioxidant and hypocholesterolemic properties of peptides from spirulina (Arthrospira platensis) », le 09 avril 2024 

  Philippe Jacques, Vincent Phalip, Barbara Fiffani, Frank Delvigne, « Competition to commensalism, Trichoderma harzianum and Bacillus velezensis interaction is strongly cultural conditions dependent », Bacell 2023, Kobe Japan, le 01 novembre 2023 

  Rémi Platel, Anca Lucau-Danila, Raymonde Baltenweck, Alessandra Maia-Grondard, Pauline Trapet, « The Bacillus subtilis lipopeptide mycosubtilin primes defense mechanisms in wheat towards Zymoseptoria tritici », ICPP Satellite Symposium PlantBioRes 2023, Lyon, le 19 août 2023 

  Emma Dutilloy, Anthony Argüelles Arias, Nicolas Richet, Matthieu Duban, Valérie Leclère, « Bioinformatics Modelling and Metabolic Engineering of the Branched Chain Amino Acid Pathway for Specific Production of Microbial Biosurfactants and Biopesticides », Congrès BIOKET dédié aux procédés et technologies appliqués à la biomasse, Trois Rivieres Canada, le 23 mai 2023 

  Aline Leconte, Justine Jacquin, Ludovic Tournant, Sandrine Oste, Caroline Dewer, « ETUDE IN VITRO ET IN PLANTA DE L’ACTIVITE ANTIFONGIQUE DE DIFFERENTS LIPOPEPTIDES DE BACILLUS SP. CONTRE VENTURIA INAEQUALIS », VÉGÉPHYL – 13e CONFÉRENCE INTERNATIONALE SUR LES MALADIES DES PLANTES, ORLEANS, le 06 décembre 2022 

  Philippe Jacques, Antoine Vassaux, Marie Rannou, Théo Daboudet, François Coutte, « Spray-drying performances of the three families of lipopeptides biosurfactant produced by Bacillus subtilis », Biosurfactant International Conference, Stuttgart Germany, le 28 septembre 2022 

  François Coutte, Arnaud Delecroix, C. Deweer, E. Dussert, Jean-Sebastien Guez, « Mycosubtilin, a multifaceted lipopeptide from Bacillus. subtilis for plant crop protection: an overview of the last decade results obtained from lab to the field. », Plant BioProtech, Reims, le 28 juin 2022 

  Philippe Jacques, Antoine Vassaux, Patrick Fickers, Valérie Leclère, « Overall strategy to implement a heterologous NonRibosomal Peptide production in a fungal host. », virtual ESBES symposium, VILLENEUVE D'ASCQ, le 15 septembre 2020 

  Rémi Platel, Maryline Calonne, Sarah Le Guenic, Vincent Lequart, L. Chaveriat, « Criblage à haut-début et caractérisation du mode d’action de nouveaux produits de biocontrôle sur le pathosystème blé-Zymoseptoria tritici », PHLOEME 2020, 2èmes biennales de la recherche et de l’innovation dans le domaine des céréales, Cite des sciences et de l'industrie, Paris, le 29 janvier 2020 

  Matthieu Duban, Maude Pupin, Areski Flissi, L. Couderc, Hélène Touzet, « Genome mining for screening and characterization of new lipopeptides with biocontrol applications. », le 27 janvier 2020 

  Nour El Houda Raouani, Béatrice Randoux, Maryline Magnin-Robert, Benoît Tisserant, Joël Fontaine, « New strategies for the production of low toxicity biomolecules, the lipopeptides from Bacillus subtilis and studies of their potentiality as biopesticides for plant protection », PlantBioProtech, Marrakech (Maroc) Morocco, le 19 novembre 2019 

  Matthieu Duban, Maude Pupin, Areski Flissi, Loïc Couderc, Loïc Meunier, « Genome mining for screening and characterization of new lipopeptides with biocontrol applications », PlantBioProtech, Marrackech Morocco, le 18 novembre 2019 

  H. Brück, François Coutte, Didier Lecouturier, Krasimir Dimitrov, Jean-Sebastien Guez, « Bioprocédés innovants pour la production de biosurfactants microbiens de nature lipopeptidique », 17ème congrès de la Société Française de Génie des Procédés (SFGP), Nantes, le 17 octobre 2019 

  Philippe Jacques, Krasimir Dimitrov, François Coutte, Didier Lecouturier, Pascal Dhulster, « Bioprocédés innovants pour la production de biosurfactants microbiens de nature », 17ème congrès de la Société Française de Génie des Procédés, SFGP, Nantes, le 15 octobre 2019 

  Philippe Jacques, Hannah Luise Bruck, François Coutte, Frank Delvigne, Pascal Dhulster, « Biofilm-based bioprocess optimization by morphology engineering of Bacillus subtilis. », The 5th EUROPEAN CONGRESS OF APPLIED BIOTECHNOLOGY, FLORENCE Italy, le 15 septembre 2019 

  Mickaël Chevalier, Emma Ricart, Emeline Hanozin, S Matthijs, Maude Pupin, « Challenge of nonribosomal peptide (NRP) identification: Kendrick mass defect for molecular formula assignment of NRPs. », 14th International IUPAC Congress, Ghent Belgium, le 19 mai 2019 

  Philippe Jacques, Ameen Al-Ali, Jovana Deravel, François Krier, Max Béchet, « Biofilm formation is determinant in tomato rhizosphere colonization by Bacillus velezensis FZB42 », 3rd Biennial International Congress on Natural Products and Biocontrol, Perpignan, le 21 septembre 2016 

  Philippe Jacques, Qassim Esmaeel, Yoann Dufresne, Areski Flissi, Maude Pupin, « Norine, Florine, s2m : powerful bioinformatics resource and tools for the discovery of novel nonribosomal peptides, natural metabolites with versatile activities », le 09 juillet 2017 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, François Coutte, Christian Larroche, « Overflowing Continuous Cultures: a way to manage excess of foaming during the sustainable production of surfactant in reactors », 6th Conference on environmental, industrial and Applied microbiology, Barcelone Spain, le 28 octobre 2015 

  Philippe Jacques, Alexandre Dehaut, Frédéric Krzewinski, Thierry Grard, Marlène Chollet, « Development of a qPCR method targeting torA gene and application for the freshness monitoring of modified atmosphere-packed chilled whiting (Merlangius merlangus) », 45th WEFTA Conference, Nantes, le 12 octobre 2015 

  Philippe Jacques, Thibaud Masy, Serge Hiligsmann, Philippe Thonart, Timothy M Vogel, « Microbial diversity and function during different bioremediation strategies of diesel-polluted soil », BAGECO 13 : The microbial continuity across changing ecosystems, Milan Italy, le 14 juin 2015 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, François Coutte, Christian Larroche, « Directed Biosynthesis of Antifungal and Biosurfactant Lipopeptides from Bacillus subtilis. », 10th European Symposium of Biochemical Science (ESBES) and 6th International Forum on Industrial Bioprocesses, Lille, le 07 septembre 2014 

  Philippe Jacques, Marlène Chollet, Frédéric Krzewinski, Assi N'Guessan, Ossarath Kol, « Use of degenerate primers to detect and quantify torA gene harbored by specific spoilage organisms of fish », le 01 septembre 2014 

  Alexandre Dehaut, Frédéric Krzewinski, Assi N'Guessan, Ossarath Kol, Thierry Grard, « Caractérisation de la qualité/fraîcheur du poisson par des approches de biochimie et de biologie moléculaire », 1ères Doctoriales de la Mer, Boulogne-sur-Mer, le 10 octobre 2013 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Laurent Bonneau, François Coutte, Christian Larroche, « Production of biosurfactants by overflowing continuous culture (O-CC) », le 08 octobre 2013 

  Philippe Jacques, Valérie Leclère, Laurent Noé, Maude Pupin, « Non Ribosomal Peptides : A monomeric puzzle », JOBIM - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Toulouse, le 01 juillet 2013 

  Philippe Jacques, Max Béchet, Joany Castéra-Guy, Nour-Eddine Chihib, François Coutte, « Novel biosurfactants with biocontrol activity and low ecotoxicity. », 9th European Congress of Chemical Engineering / 2nd European Congress of Applied Biotechnology, The Hague Netherlands, le 21 avril 2013 

  Philippe Jacques, François Coutte, Mirabelle Nebut, Joachim Niehren, « Knockout Prediction for Reaction Networks with Partial Kinetic Information: Application to Surfactin Overproduction in Bacillus subtilis », 3rd International Symposium on Antimicrobial Peptides, Lille, le 14 juin 2012 

  François Coutte, Mathias John, Max Béchet, Mirabelle Nebut, Joachim Niehren, « Engineering of Bacillus subtilis physiological functionalities towards the production of mycosubtilin anteiso-C17 », Journées Ouvertes en Biologie, l'Informatique et les Mathématiques - JOBIM 2012, Rennes, le 23 septembre 2012 

  Jean-Sebastien Guez, Joany Castéra-Guy, Françoise Coucheney, Max Béchet, Nour-Eddine Chihib, « Environmental factors and pleitropic regulators influence homologous compound pattern of mycosubtilin produced by Bacillus subtilis ATCC 6633. », 5th International Conference on Functional Genomics of Gram-positive Microorganisms / 16th International Conference on Bacilli, Montecatini Italy, le 14 juin 2011 

  Philippe Jacques, Salah Cheniker, Jean-Philippe Cassar, Jean-Sebastien Guez, « Predictive Control of the Specific Growth Rate in a Bioreactor Process for the Production of Surfactant Using Bacillus Subtilis. », IFAC Symposium Computer Applications in Biotechnology, Leuven Belgium, le 07 juillet 2010 

  Philippe Jacques, Max Béchet, François Coutte, Jovana Deravel, Jean-Sebastien Guez, « Les lipopeptides de Bacillus sp. : des molécules à haut potentiel pour la lutte biologique contre les champignons phytopathogènes », 3éme Journée du Groupe Francophone d’Étude des Pesticides Organiques d’Origine Naturelle, Lyon, le 17 juin 2010 

  Joany Castéra-Guy, Jean-Sebastien Guez, Nour-Eddine Chihib, Françoise Coucheney, Max Béchet, « Cellular Engineering of Bacillus subtilis to Enhance the Biosynthesis of Highly Active Antifungal Lipopeptides », le 22 mars 2010 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Salah Chenikher, Jean-Philippe Cassar, « Overflowing processes for the production of surfactants in bioreactors », 12ème Congrès de la Société Française de Génie des Procédés (SFGP), Marseille, le 14 octobre 2009 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, François Coutte, Pierre Marie Danzé, Joany Castéra-Guy, « Resistance of Bacillus subtilis ATCC 6633 cell wall to degradation is a critical parameter for isolation of high quality RNA », le 14 juin 2009 

  Jean-Sebastien Guez, Patrick Fickers, Max Béchet, Valérie Leclère, Françoise Coucheney, « Relationship between temperature, branched fatty acid synthesis and mycosubtilin isoform production in Bacillus subtilis. », BACELL, Copenhagen Denmark, le 21 avril 2009 

  Philippe Jacques, Valérie Leclère, Max Béchet, François Coutte, Marlène Chollet-Imbert, « Genetic and bioprocess engineering applied to the overproduction of biosurfactant from Bacillus subtilis. », International Congress on Bioprocesses in Food Industries, Hyderabad India, le 06 novembre 2008 

  Philippe Jacques, Salah Cheniker, Jean-Sebastien Guez, Jean-Philippe Cassar, « A new feeding strategy to operate overflowing-exponential fedBatch cultures (O-EFBC) at constant specific growth rates : Application to the production of biosurfactant by Bacillus subtilis », le 07 octobre 2008 

  Jean-Sebastien Guez, Max Béchet, Laurent Bonneau, Anne Sophie Drucbert, Pierre Marie Danzé, « An inverse metabolic engineering strategy to direct the antibiotic mycosubtilin biosynthesis toward the anteisoC-17 branched isoform in Bacillus subtilis », le 07 septembre 2008 

  François Coutte, Valérie Leclère, Max Béchet, Jean-Sebastien Guez, Didier Lecouturier, « Consequences of both constitutive synthesis of surfactin and disruption of plipastatin operon on phenotypic properties of Bacillus subtilis », le 14 juin 2008 

  Valérie Leclère, Max Béchet, Alain Brans, François Coutte, Marlène Chollet-Imbert, « Bacillus lipopeptides leading to versatile weapons for plant disease biocontrol. », Bacell, oslo Sweden, le 27 mars 2008 

  Françoise Coucheney, Valérie Leclère, Max Béchet, Frédérique Gancel, Marlène Chollet-Imbert, « La synthèse non-ribosomique, un potentiel immense de peptides à activités biologiques », le 13 novembre 2007 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Anne-Sophie Drucbert, Pierre Marie Danzé, « Directing the lipopeptide mycosubtilin biosynthesis toward C17:0 anteiso isoform influences the expression of cspB and cspC in Bacillus subtilis », le 24 juin 2007 

  Philippe Jacques, Max Béchet, Marlène Chollet-Imbert, Françoise Coucheney, Frédérique Gancel, « Étude de l’effet de l’oxygène sur la synthèse de peptides d’origine non ribosomiques par Bacillus subtilis », 7ème congrès national de la Société Française de Microbiologie, Nantes, le 30 mai 2007 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Karsten Müller, Aurore Gheeraert, Jochen Büchs, « Production of lipopeptide biosurfactant under oxygen growth-limiting conditions in surface aerated cultures of Bacillus », le 27 août 2006 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Benjamin Destée, Valérie Leclère, Max Béchet, « Etude d’un bioprocédé en réacteur semi-discontinu accompagné de pertes par moussage : application à l’extraction de tensioactifs lipopeptidiques produits par Bacillus subtilis », 10ème congrès de la Société Française de Génie des Procédés (SFGP), Toulouse, le 20 septembre 2005 

  Valérie Leclère, Max Béchet, Frédérique Gancel, Jean-Sebastien Guez, Marlène Chollet-Imbert, « Optimisation strategies of antibiotic lipopeptide production by Bacillus subtilis », 5th European Symposium of Biochemical Science (ESBES), Stuttgart Germany, le 08 septembre 2004 

  Philippe Jacques, Jean-Sebastien Guez, Valérie Leclère, Max Béchet, Hervé Joiris, « Influence of pH on the production of mycosubtilin, an antifungal metabolite from Bacillus subtilis with potential applications in agro-food sector », le 11 juillet 2004 

  Philippe Jacques, Jean-Philippe Cassar, Jean-Sebastien Guez, « Stoechiometric modeling for physiological state changes monitoring in bioprocesses », 9th International Symposium on Computer Applications in Biotechnology (CAB 9), Nancy, le 28 mars 2004 

  Philippe Jacques, Joany Castéra-Guy, Françoise Coucheney, Jean-Sebastien Guez, Nour-Eddine Chihib, « Effect of low temperatures on growth and biosurfactant production in Bacillus subtilis », 4th congress of European microbiologists FEMS, Geneva Switzerland, le 26 juin 2001 

  Philippe Jacques, Laurent Fleury, Chaabane Djeraba, Henri Briand, « Some Aspect of Rule Discovery in Data Bases », Information Systems and Data Management, 6th International Conference, CISMOD'95, Bombay India, le 15 novembre 1995 

  Philippe Jacques, Laurent Fleury, Chaabane Djeraba, Henri Briand, « Rule Evaluations in a {KDD} System », Database and Expert Systems Applications, 6th International Conference, DEXA'95, London United Kingdom, le 04 septembre 1995 

  Philippe Jacques, Joachim Niehren, Mathias John, Cristian Versari, François Coutte, « Qualitative Reasoning about Reaction Networks with Partial Kinetic Information », Computational Methods for Systems Biology, Nantes, le 30 novembre -0001 

Encadrement doctoral

• Thèses dirigées

  Flora Vern, Les objets juridiques : recherches en droit des biens, soutenue en 2018 à Paris Institut détudes politiques présidée par Jean-Louis Bergel, membres du jury : William Dross (Rapp.), Rémy Libchaber (Rapp.), Blandine Mallet-Bricout et Michel Vivant  

  Les biens ne semblent exister que pour être classés, distingués et appropriés, mais ne sont guère envisagés indépendamment des droits réels qui s’y rapportent. Or, la multiplication pléthorique des droits réels pourrait bien révéler la diversité des objets possibles du droit réel. Ces objets ne sont pas des choses du monde extérieur, mais une réalité abstraite que le droit construit au terme d’une opération de qualification: ce sont des objets juridiques, parce qu’ils sont déjà envisagés par le droit objectif à l’occasion de l’application d’une règle de droit positif qui impose l’appréciation de certains éléments de fait propres à en révéler l’existence. Le droit objectif construit donc une réalité qui lui est propre, avant même qu’il soit fait référence à un éventuel droit réel. Pour autant, la technique juridique n’est jamais inerte. Il existe des mécanismes permettant à la volonté de modifier la consistance ou l’affectation des objets juridiques et, partant, d’agir sur le régime des biens. Ces opérations sont à la fois caractéristiques et spécifiques de la technique du droit réel, employée pour façonner la réalité que perçoit le droit objectif. Les prétentions subjectives à la jouissance des objets juridiques rejaillissent, cependant, sur la conception que l’on se fait du droit réel, au point d’occulter sa dimension technique derrière les prérogatives qu’il semble conférer aux sujets de droit.

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  Tarik Lakssimi, La summa divisio des droits réels et des droits personnels : étude critique, soutenue en 2014 à Paris Est sous la direction de Nathalie Peterka, membres du jury : Pascal Ancel, William Dross et Philippe Brun   

  Il est devenu commun, pour la doctrine civiliste, de présenter la scène juridique par la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Les premiers permettent aux personnes d'exercer leur domination sur le monde des choses, tandis que les seconds constituent des liens de droit entre personnes – des obligations. Si la structure du droit réel apparaît, ainsi, comme un lien direct entre une personne et une chose, celle du droit personnel souffre la présence d'un débiteur, contre lequel s'exerce le droit. La doctrine considère que cette opposition structurelle des droits réels et des droits personnels se traduit, concrètement, par une différence de régime au profit du droit réel : ce dernier serait supérieur au droit personnel, du fait, notamment, de la plus grande efficacité de son régime de protection. Or, la thèse donne d'abord l'occasion de constater que cette hiérarchie dans le régime de protection des droits réels et des droits personnels ne trouve aucun fondement en droit positif. En conséquence, dès lors que la différence de régime des droits réels et des droits personnels est présentée par la doctrine comme la traduction de l'opposition structurelle de ces droits, la pertinence de cette classification structurelle apparaît douteuse. Pour autant, la thèse conduira à la conservation de la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Ce maintien requiert, néanmoins, de modifier le critère de distinction qui organise actuellement la summa divisio, à savoir la prétendue supériorité du droit réel sur le droit personnel. Le plan suivi pour cette démonstration est le suivant : I : L'origine de la summa divisio II : Les incohérences de la summa divisio III : La correction de la summa divisio

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  Ahlam Guessoum, Force exécutoire et obligation : essai sur l'exécution forcée en droit privé., soutenue en 2014 à Grenoble en co-direction avec Philippe Brun présidée par Olivier Gout, membres du jury : Pascal Ancel (Rapp.), Mustapha Mekki (Rapp.)   

  L'inexécution de l'obligation par le débiteur constitue un moment crucial dans la « vie » de l'obligation. La force de l'obligation à apporter des remèdes efficaces au créancier se pose avec le plus d'acuité à cet instant. Analyser l'obligation sous l'angle de son efficacité concrète conduit à un constat immédiat. La force obligatoire, omniprésente dans le régime de l'obligation, se voit attribuer une fonction dont l'effectivité est, pourtant, dans le contexte de l'inexécution, résiduelle. Inefficace, à cet instant, la force obligatoire ne saurait, en aucune manière, constituer le fondement de la sanction de l'obligation par l'exécution forcée. Mais, sans lui retirer toute utilité, la force obligatoire permet de causer le paiement spontané de l'obligation en dehors de tout conflit lié à l'exécution. En revanche, tant la définition de sanction que celle de contrainte évoquent la notion de force et d'exécutoire. La force exécutoire embrasse l'obligation dès lors qu'est entreprise l'obtention de son efficacité économique consécutivement au constat de son inexécution. La prise en compte de l'obligation dans le régime exécutoire invite à penser la notion de force exécutoire au-delà de son sens traditionnel : la force exécutoire ne se définit pas exclusivement comme une compétence. Ainsi, matérialisée dans un titre exécutoire, la force exécutoire est, et au delà d'une simple condition de ce titre, une force en rapport avec l'obligation. L'efficacité de la sanction de l'exécution forcée dépend entièrement de l'effectivité de la force exécutoire dont est assorti le titre exécutoire. Le titre exécutoire ne constitue pas un simple instrumentum assorti de la force probante des actes authentiques et de la formule exécutoire, il est aussi un negotium dont l'obligation exécutoire est un élément.Aucune exécution forcée ne peut être poursuivie en l'absence de titre exécutoire, aucun titre exécutoire ne peut être mis en oeuvre sans obligation exécutoire.

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• Président du jury

  Ying Jiang, Étude comparée de la responsabilité délictuelle du fait d’autrui en France et en Chine, soutenue en 2010 à Paris Est sous la direction de François Chabas, membres du jury : Fabrice Gréau (Rapp.)   

  Cette étude traite de la comparaison du régime de la responsabilité délictuelle du fait d’autrui en droit français et en droit chinois.Dans une première partie, plutôt micro-vision, la thèse se consacre à une étude au cas par cas des responsabilités du fait d’autrui dans les deux systèmes juridiques. Il s’agit précisément de la responsabilité du fait des mineurs (la responsabilité des parents en droit français et des tuteurs en droit chinois ainsi que la responsabilité des instituteurs en droit français et des établissements scolaires en droit chinois), de la responsabilité des employeurs du fait des personnes qu’ils emploient dans les deux droits et de la responsabilité générale du fait d’autrui qui est admise particulièrement en droit français, à la différence du droit chinois.La deuxième partie apporte une vision d’ensemble et propose au sein des deux systèmes de droit une étude des rapports internes du régime entre les différentes hypothèses de cette responsabilité ainsi qu’un examen des rapports externes de ce régime avec les responsabilités personnelles de droit commun et les mécanismes d’indemnisation collective.Pourtant, de ce mécanisme appliqué aux deux systèmes, l’analyse révèle un inconvénient commun : une harmonisation du régime fait défaut. A cet égard, sous la condition préalable de ne pas nuire à la particularité de chaque cas de figure, l’étude tente de restaurer une cohérence tant dans les rapports « internes » du régime de responsabilité du fait d’autrui, que dans ses rapports « externes » avec d’autres régimes.

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• Membre du jury

  Flora Vern, Les objets juridiques : recherches en droit des biens, soutenue en 2018 à Paris Institut détudes politiques présidée par Jean-Louis Bergel, membres du jury : William Dross (Rapp.), Rémy Libchaber (Rapp.), Blandine Mallet-Bricout et Michel Vivant  

  Les biens ne semblent exister que pour être classés, distingués et appropriés, mais ne sont guère envisagés indépendamment des droits réels qui s’y rapportent. Or, la multiplication pléthorique des droits réels pourrait bien révéler la diversité des objets possibles du droit réel. Ces objets ne sont pas des choses du monde extérieur, mais une réalité abstraite que le droit construit au terme d’une opération de qualification: ce sont des objets juridiques, parce qu’ils sont déjà envisagés par le droit objectif à l’occasion de l’application d’une règle de droit positif qui impose l’appréciation de certains éléments de fait propres à en révéler l’existence. Le droit objectif construit donc une réalité qui lui est propre, avant même qu’il soit fait référence à un éventuel droit réel. Pour autant, la technique juridique n’est jamais inerte. Il existe des mécanismes permettant à la volonté de modifier la consistance ou l’affectation des objets juridiques et, partant, d’agir sur le régime des biens. Ces opérations sont à la fois caractéristiques et spécifiques de la technique du droit réel, employée pour façonner la réalité que perçoit le droit objectif. Les prétentions subjectives à la jouissance des objets juridiques rejaillissent, cependant, sur la conception que l’on se fait du droit réel, au point d’occulter sa dimension technique derrière les prérogatives qu’il semble conférer aux sujets de droit.

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  Tarik Lakssimi, La summa divisio des droits réels et des droits personnels : étude critique, soutenue en 2014 à Paris Est sous la direction de Nathalie Peterka, membres du jury : Pascal Ancel, William Dross et Philippe Brun   

  Il est devenu commun, pour la doctrine civiliste, de présenter la scène juridique par la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Les premiers permettent aux personnes d'exercer leur domination sur le monde des choses, tandis que les seconds constituent des liens de droit entre personnes – des obligations. Si la structure du droit réel apparaît, ainsi, comme un lien direct entre une personne et une chose, celle du droit personnel souffre la présence d'un débiteur, contre lequel s'exerce le droit. La doctrine considère que cette opposition structurelle des droits réels et des droits personnels se traduit, concrètement, par une différence de régime au profit du droit réel : ce dernier serait supérieur au droit personnel, du fait, notamment, de la plus grande efficacité de son régime de protection. Or, la thèse donne d'abord l'occasion de constater que cette hiérarchie dans le régime de protection des droits réels et des droits personnels ne trouve aucun fondement en droit positif. En conséquence, dès lors que la différence de régime des droits réels et des droits personnels est présentée par la doctrine comme la traduction de l'opposition structurelle de ces droits, la pertinence de cette classification structurelle apparaît douteuse. Pour autant, la thèse conduira à la conservation de la summa divisio des droits réels et des droits personnels. Ce maintien requiert, néanmoins, de modifier le critère de distinction qui organise actuellement la summa divisio, à savoir la prétendue supériorité du droit réel sur le droit personnel. Le plan suivi pour cette démonstration est le suivant : I : L'origine de la summa divisio II : Les incohérences de la summa divisio III : La correction de la summa divisio

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