Thèse
La contribution des relations extérieures à la construction de l'ordre constitutionnel de l'Union Européenne. Thèse soutenue en 2009 à Bordeaux 4, sous la direction de Jean-Claude Gautron.
Ouvrages
Hugo Flavier, Francette Fines, Leila Lankarani El-Zein et Ludovic Royer (dir.), La puissance russe, entre émergence et renaissance, Éditions Pedone, 2019, 222 p. 
Hugo Flavier, Jacques Viguier, Corinne Mascala, Philippe Nélidoff, Vincent Dussart, Xavier Bioy, Mathilde Philip-Gay, Clément Benelbaz, Christine Mengès-Le Pape, Mathieu Touzeil-Divina, Valérie Rabault, Hiam Mouannès, Brigitte Barèges, Jean-Charles Jobart, Bertrand Sergues, Laura Barbier, Salim Daccache s.j et Vincent Sempastous, La territorialité de la laïcité : actes du colloque du 28 mars 2018, Presses de l'Université Toulouse 1 Capitole, 2019
Hugo Flavier, Clément Benelbaz, Olga Belova et Moya Jones (dir.), Les Migrations intra-européennes à l'aube du XXIème siècle, Editions Pedone, 2014
Hugo Flavier et Jean-Pierre Moisset (dir.), L'Europe des religions, Editions Pedone, 2013, Collection Droits européens, 202 p.
Hugo Flavier, La contribution des relations extérieures à la construction de l'ordre constitutionnel de l'Union européenne, E. Bruylant, 2012, Collection Droit de l'Union européenne, 885 p.
Hugo Flavier, La contribution des relations extérieures à la construction de l'ordre constitutionnel de l'Union Européenne, 2009, 759 p.
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Hugo Flavier, L'interprétation par le juge communautaire des accords conclus par la Communauté, 2003, 152 p.
Articles
Hugo Flavier, « L'Union européenne et l'Union économique eurasiatique: quelles relations? », Olivier Delas (dir.), Relations commerciales internationales. L'Union européenne et l'Amérique du Nord à l'heure de la nouvelle route de la soie, 2020, p. NC
Hugo Flavier, « Parliamentary Cooperation and Diplomacy in EU External Relations. An Essential Companion », in Kolja Raube, Meltem Müftüler-Baç and Jan Wouters (dir.), Common Market Law Review, Edward Elgar Publishing, 2020, p. 2007 – 2008
Hugo Flavier, « L’Union économique eurasiatique : In varietate concordia ? », Revue générale de droit international public, 2019, p. NC
Hugo Flavier, « Le principe de laïcité en Russie et le port des signes religieux à l’école », La territorialité de la laïcité, Presses de l’Université Toulouse 1 Capitole, 2018, p. NC
Hugo Flavier, Mauro Gatti et Eleftheria Neframi, « Réflexions sur la démocratisation des relations extérieures à l’aune du contentieux de l’accès aux documents », Constitutional Issues of EU External Relations Law, Nomos Verlagsgesellschaft mbH & Co. KG, 2018, p. NC
Hugo Flavier, Kseniia Ivanova et Irina Chikireva, « Disciplinary responsibility’s application to the local government employees violating the anti-corruption legislation in the Russian Federation, Europe and the United States of America », BRICS Law Journal, N° 4, 2017, p. NC
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Hugo Flavier, Laurent Pech et Platon Sébastien, « Liberté d'expression des agents publics », JurisClasseur Collectivités territoriales [Encyclopédie juridique Juris-classeur], 2017, p. NC
Hugo Flavier, « Parlement européen et relations extérieures : une révolution démocratique en marche ? », RTDEur. Revue trimestrielle de droit européen, N° 2, 2016, p. 293 
Hugo Flavier, « Boris Mirkine-Guetzévitch : La conscience juridique des peuples, moteur de l’évolution des rapports entre droit international et droit constitutionnel », Constitution et droit international. Regards sur un siècle de pensée juridique française (dir. O. Dupéré), 2016, p. NC
Hugo Flavier, « La migration des élites juridiques en Europe. Réflexions sur l’influence de l’Union européenne sur les professions juridiques réglementées françaises », C. Benelbaz, O. Gilles-Belova, H. Flavier, M. Jones (dir), Les migrations intra-européennes à l’aube du XXIe siècle, 2014, p. NC
Hugo Flavier et Platon Sébastien, « Langues régionales, langues d’État et unité de l’État : approche comparée franco-russe », A. Viaut et S. Moskvitcheva (dir.) Langues régionales, langues d’État et unité de l’État : approche comparée franco-russe, Maison des Sciences de l’Homme d’Aquitaine, 2014, p. NC
Hugo Flavier, « Le financement public des cultes dans les démocraties européennes », Hugo Flavier, Jean-Pierre Moisset (dir.), L'Europe des religions, 2013, p. NC
Hugo Flavier, « Le voisinage commun de l’Union européenne et de la Russie », Loïc Grard (dir.), L’Europe face au monde, 2013, p. NC
Hugo Flavier, « Les instruments européens de protection des mineurs contre l’exploitation sexuelle », Marie Gautier, Catherine Gauthier, Adeline Gouttenoire (dir.), Mineurs et droits européens, 2012, p. NC
Hugo Flavier, « Le financement public des cultes en France et le principe de laïcité », Revue du droit public et de la science politique en France et à l'étranger, 2010, p. NC
