Thèse
The "European integration paradox" : comparing EU practice and discourse on the role of parliaments in the EU in the Assemblée nationale and the Bundestag across time. Thèse soutenue en 2016 à Institut d'études politiques de paris - Sciences Po, sous la direction de Christian Lequesne et de Wolfgang Wessels, membres du jury : Martina Fuchs [Président], Christine Neuhold [Rapporteur], Yves Surel [Rapporteur] et Olivier Rozenberg.
Ouvrages
Anja Thomas, Nathalie Berny et Viviane Gravey (dir.), Les turbulences du Brexit, L'Harmattan, 2021, 195 p. 
Anja Thomas, Assemblée nationale, Bundestag and the European Union : the micro-sociological causes of the European integration paradox, Nomos, 2019, Studies on the European Union, 359 p.
Anja Thomas, The "European integration paradox" : comparing EU practice and discourse on the role of parliaments in the EU in the Assemblée nationale and the Bundestag across time, Sciences Po, 2016, 2 vol. , p.
Articles
Anja Thomas, Nathalie Berny et Viviane Gravey, « Les turbulences du Brexit :légitimité démocratique, gouvernance et action publique », Politique européenne, N° 3, 2021, pp. 8-30
Anja Thomas et Christian Lequesne, « L’Allemagne, le Bundestag et le Parlement européen : du Traité de Maastricht au Traité de Lisbonne », Relations internationales, N° 184, 2020, pp. 55 - 72
Anja Thomas, « G. Barret, The evolving roles of national parliaments in the European Union. Ireland as a case study », RTDEur. Revue trimestrielle de droit européen, N° 3, 2020 
Anja Thomas et Angela Tacea, « The French parliament and the EU “Shadow control” through the government majority », in Claudia Hefftler, Christine Neuhold, Olivier Rozenberg, Julie Smith, Wolfgang Wessels (dir.), The Palgrave Handbook on National Parliaments and the European Union, Palgrave Macmillan, 2015, pp. 170 - 190
Anja Thomas, « Catherine Guisan. A Political Theory of Identity in European Integration », EUSA Review, N° 1, 2013, pp. 14 - 15
Autre
Anja Thomas, Katrin Auel et Olivier Rozenberg, Lost in Transaction? Parliamentary. Reserves in EU bargains, p. NC
