Thèse
L'organisation des marchés des produits de la pêche dans la Communauté économique européenne. Thèse soutenue en 1989 à Brest, sous la direction de Jean-Pierre Beurier.
Ouvrages
Annie Cudennec et Gaë͏lle Gueguen-Hallouët (dir.), L'Union européenne et la mer : soixante ans après les Traités de Rome actes du colloque de Brest, Editions A. Pédone, 2019, 401 p. 
Annie Cudennec (dir.), Ordre public et mer : actes du colloque de Brest, 12 et 13 mai 2011, A. Pédone, 2012, 270 p.
Annie Cudennec et Cécile de Cet Bertin (dir.), Mer et responsabilité : actes du colloque de Brest, 16 et 17 octobre 2008, A. Pedone, 2009, 218 p.
Annie Cudennec et Gaë͏lle Gueguen-Hallouët (dir.), L'Union européenne et la mer : vers une politique maritime de l'Union européenne ? actes du colloque de Brest, 18 et 19 octobre 2006, A. Pedone, 2007, 437 p.
Annie Cudennec (dir.), Le droit pénal et la mer, Presses universitaires de Rennes, 2006, L'Univers des normes, 200 p.
Annie Cudennec et Gaë͏lle Gueguen-Hallouët (dir.), Le juge communautaire et la mer : journée d'études, Bruylant, 2003, Collection Rencontres européennes, 188 p.
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Annie Cudennec, L'organisation des marchés des produits de la pêche dans la Communauté économique européenne, [s.n.], 1989
Articles
Annie Cudennec, Gaëlle Guéguen-Hallouët, Nicolas Boillet, Cécile de Cet-Bertin, Betty Queffelec et Muriel Taillens, « Chronique maritime », Revue de l'Union européenne, N° 671, 2023, p. 505 
Annie Cudennec, « La contribution de l'Union européenne à la lutte contre la dégradation du milieu marin », Revue de l'Union européenne, N° 667, 2023, p. 216
Annie Cudennec, Gaëlle Guéguen-Hallouët, Nicolas Boillet, Cécile de Cet-Bertin, Betty Queffelec et Muriel Taillens, « Chronique maritime », Revue de l'Union européenne, N° 659, 2022, p. 358
Annie Cudennec, Gaelle Gueguen Hallouet, Nicolas Boillet, Cécile de Cet-Bertin, D. Baudelet et Muriel Taillens, « Chronique maritime », Revue de l'Union européenne, N° 649, 2021, p. 371
Annie Cudennec, Betty Queffelec, Marie Bonnin, Beatrice Ferreira, Sophie Bertrand, Solange Teles da Silva, Fatou Diouf, Brice Trouillet, Adrien Brunel, Odeline Billant et Hilde Toonen, « Marine spatial planning and the risk of ocean grabbing in the tropical Atlantic », ICES Journal of Marine Science, 2021, p. NC
Annie Cudennec, Gaelle Gueguen Hallouet, Nicolas Boillet, Cécile de Cet-Bertin, Betty Queffelec et Muriel Taillens, « Chronique maritime », Revue de l'Union européenne, N° 638, 2020, p. 308
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Annie Cudennec, Nicolas Boillet, Olivier Curtil, Cécile de Cet Bertin, Gaëlle Guéguen-Hallouët, Betty Queffelec et Muriel Taillens, « Chronique maritime », Revue de l'Union européenne, N° 625, 2019, p. NC
Annie Cudennec, Betty Queffelec, Gaëlle Gueguen Hallouet, Muriel Taillens, Nicolas Boillet et Cecile de Cet Bertin, « Chronique maritime - 1er juillet – 31 décembre 2018 », Revue de l'Union européenne, 2019, p. NC
Annie Cudennec, « La politique maritime intégrée: terrain privilégié de la transition écologique », in Agathe Van Lang (dir.), Penser et mettre en oeuvre les transitions écologiques, Editions Mare et Martin, 2018, pp. 165--176
Annie Cudennec et Gilles Lazuech, « POLITIQUE COMMUNE DE LA PÊCHE (PCP) », in Agathe Van Lang, François Collart Dutilleul, Valérie Pironon (dir.), Dictionnaire juridique des transitions écologiques, Institut Universitaire Varenne, 2018, p. NC
Annie Cudennec, Jason S. Link, Olivier Thébaud, David C. Smith, Anthony D. M. Smith, Jörn Schmidt, Jake Rice, Jan Jaap Poos, Cristina Pita, Doug Lipton, Marloes Kraan, Stewart Frusher, Luc Doyen, Keith Criddle et Denis Bailly, « Keeping Humans in the Ecosystem », ICES Journal of Marine Science, N° 7, 2017, pp. 1947--1956
Annie Cudennec, « The European Legal Framework for Marine Renewable Energies », Ocean Yearbook, N° 1, 2016, pp. 488-503
Annie Cudennec, « La politique européenne de gestion et d’exploitation durable des ressources marines vivantes », in André Monaco, Patrick Prouzet (dir.), Gouvernance des mers et des océans, ISTE Editions, 2015, pp. 115--140
Annie Cudennec, « Le processus européen de planification de l'espace maritime », in Carina Costa de Oliveira (dir.), Meio Ambiente Marinho e Direito - Volume 2, Jurua, 2015, pp. 209--221
